細胞生物学 – コロラド対ジョージア工科大学

AI モデルはどの乳がん治療薬が最も効果があるかを予測します

乳がん細胞の移動。クレジット: Christoph Burgstedt / SPL 乳がん (TNBC) 患者にとって最も効果的な治療法を選択することは、腫瘍が分子レベルで大きく異なる可能性があるため、多くの場合困難です。今回、研究者らは、人の腫瘍細胞がさまざまな薬剤にどのように反応するかを予測することで、この進行性の乳がんに対する最適な治療法を選択するのに役立つ人工知能ベースの「仮想細胞モデル」を開発した。 TNBC 細胞には、エストロゲンとプロゲステロンというホルモンの受容体と、細胞の増殖を制御するタンパク質が欠如しています。ホルモンや標的療法は腫瘍細胞を標的にすることができないため、このことが治療をより困難にします。 TNBC患者から採取した生検を使用した実験では、仮想細胞モデルは、人間に投与した場合に効果があるのと同じ薬剤を同定する上で有望な結果を示した。著者らは、これにより、乳がん症例の15～20％を占めるTNBCに対して、より個別化されたケアが可能になる可能性が高まると述べている。「仮想細胞モデルが研究室から出て、臨床シナリオでテストされたのはこれが初めてです」と、研究の共著者で中国杭州のウェストレイク大学のプロテオミクス専門家であるティアンナン・グオ氏は言う。 Guo 氏は、この AI モデルは、細胞挙動の包括的なモデリングを提供するのではなく、TNBC の創薬において「非常に焦点を絞った目標」を持っていると付け加えました。での研究自然 9月9日1。重点モデル研究者たちは、しばらくの間、細胞寿命のコンピューターシミュレーションを開発してきました。ただし、ほとんどのアプローチには、単一セルのシーケンスデータに対するディープニューラルネットワークのトレーニングが含まれており、セルの静的な状態をキャプチャする傾向があります。研究では、Guo 氏らはプロテオミクスデータを使用して乳がん細胞の仮想モデルを開発することを目的としていました。彼らは、18 の乳がん細胞株から収集された 3,800…

薬物送達は細胞内にあります

Nature、オンライン公開: 2026 年 9 月 9 日。土井: 10.1038/d41586-026-02659-2 ミトコンドリアや他の細胞小器官を標的とした治療法が臨床で試験されています。 Source link

「スーパーダーク」タンパク質はGタンパク質共役受容体に似ているが、異常な挙動を示す

Nature、オンライン公開: 2026 年 9 月 9 日。土井: 10.1038/d41586-026-02472-x 予測された数百万の AI 構造をマイニングすると、受容体ファミリーのメンバーに似ているが機能が異なる、進化的に保存されたタンパク質が明らかになります。 Source link

細胞スケールでのプロテオーム検査

哺乳類の受精卵が分裂すると、一見同一に見える 2 つの娘細胞が生成されます。それらの系統の中には、胚のさまざまな器官系を形成する系統もあれば、発生プロセスをサポートする胚組織を形成する系統もあります。 2025 年、研究者らは単一細胞プロテオミクス (SCP) と呼ばれる先駆的な技術を使用して、2 つの第一世代細胞であってもこの分業がすでに確立されていることを示しました。1。マサチューセッツ州ボストンにあるノースイースタン大学のニコライ・スラヴォフ氏は、パサデナにあるカリフォルニア工科大学の細胞生物学者マグダレナ・ゼルニカ・ゲッツ氏とツイ・フェン・チョウ氏とともに研究を主導したが、これら2つの細胞のタンパク質組成が「アルファ」と「脂肪の特徴」を明らかにしていると述べている。通常、アルファ細胞は胚の外側組織を形成するが、「ベータ細胞はアルファ細胞よりも健康な胚を生み出す可能性が高い」と彼は言う。チームはこれらの個体を受精まで追跡することができる。タンパク質は細胞内のどこへ行くのでしょうか？次世代技術が分子の隠された生命をマッピングするこのテクノロジーには他の疑問も投げかけられています。たとえば、腫瘍形成における臨床的に最も重要な出来事の多くは、混沌とした腫瘍環境に隠された個々の細胞に由来することが研究者らは現在認識されています。「単細胞プロテオミクスは、なぜ患者の腫瘍進化、免疫反応、細胞分化によって異なる転帰が生じるのかを理解するのに役立ちます。すべては細胞の不均一性によるものです」と、台北の中央アカデミーの質量分析計である Yu-Ju Chen 氏は述べています。ほんの数年前、タンパク質生物学者は、単一細胞プロテオミクス（個々の細胞内の何千ものタンパク質のプロファイリング）の可能性を SF の話として却下しました。ドイツ、マルティンスリートにあるマックス・プランク生化学研究所のプロテオミクス研究者、マティアス・マン氏は、「あまりにも遠いことのように思えたので、『一生にない』と言ったのをほとんど覚えている」と話す。しかし、過去 10 年間で、SCP は可能になっただけでなく、実用的で科学的に有益なものになりました。マン自身は現在、SCP を使用して肝臓疾患からアルツハイマー病に至るまでの疾患を研究する訓練を受けた実践者です。しかし、参入障壁は依然として高く、細胞タンパク質の大規模処理には高価な機器、深い専門知識、正確な方法論が必要であるため、この技術の潜在的な変革的影響は依然として制限されています。貴重な貨物生物学はすでに単細胞時代に突入していますが、そのような分析のほとんどはトランスクリプトームに焦点を当てています。個々の細胞レベルでの遺伝子発現プロファイリングは、細胞の正体や生理学的状態に関する貴重な情報を提供します。しかし研究者は、RNA だけから細胞のタンパク質含有量を必ずしも予測できるわけではありません。すべての RNA が翻訳されるわけではなく、特定の転写物からのタンパク質生成のタイミングと程度は複数の要因によって決まります。多くの病気のメカニズムは、タンパク質の組成を研究することでよりよく理解できます。たとえば、アルツハイマー病やパーキンソン病の病理は、タンパク質の凝集体の乱れと強く関連しています。「プロテオームは細胞の現在の状態を反映しています」とマン氏は言う。単一細胞プロテオミクスに焦点を当てるこの状態を調査するために、プロテオミクス研究者は通常、質量分析 (MS)…